Die Sammlung ist eine der bedeutendsten Sammlungen ihrer Art in Deutschland mit 10.000 Zähleinheiten Skelettmaterial und 5.000 Zähleinheiten Alkoholmaterial überwiegend großer Säugetiere. Schwerpunkte der Sammlung sind Hornträger und Wale, Unpaarhufer, Primaten, Raubtiere, Meeressäuger und Fledermäuse. Insgesamt beherbergt die Säugetiersammlung mehr als 17.000 Individuen. Von großer Bedeutung ist die Sammlung von Gehirnen.